Bad Karlshafen ist nicht nur Heil- und Kurort, sondern auch eine alte Hugenottenstadt. Die Eröffnung eines Hugenottenmuseums in einer ehemaligen Tabakfabrik im Jahr 1989 war daher eine logische Schlussfolgerung.
Das Museum gibt Einblicke in das Leben französischer und deutscher Hugenotten. Der Name Hugenotte entstand im 16. Jahrhundert als Schimpfwort für die reformierten Christen Frankreichs. Diese sahen sich gezwungen, vor den Verfolgungen in dem katholischen Land zu fliehen und kamen so nach Deutschland. Ihre Aufnahme und Eingliederung hier ist neben diversen Sonderausstellungen weiterer Bestandteil des Hugenottenmuseums. Außerdem werden verschiedene Veranstaltungen und eine Museumsralley durchgeführt. Wer gerne draussen ist, kann sich geschichtlich auf dem Karlshafener Museumspfad informieren, der vom Hugenottenmuseum zum Hugenottenturm in ca. 1,5 Stunden führt.